Největší výhodou hypoték oproti ostatním úvěrovým produktům pro podnikatele jsou nízké úrokové sazby – ty si banky mohou dovolit díky kvalitnímu zajištění. Úroky hypoték pro podnikatele začínají tam, kde končí sazby pro občany, tedy od ročního úroku sedm procent. Provozní a investiční úvěry jsou zpravidla úročeny sazbami nad 10 %. Naopak nevýhodou je finanční spoluúčast, protože banky hypotéky pro podnikatele financují zpravidla jen do 70 nebo 80 % odhadní ceny nemovitosti.